藻生物量细胞计数的一种新方法

藻细胞生物量计数

在做藻类菌类实验的时候最繁琐就是进行生物量的计数,没有现成的自动化工具,上海光语生物科技有限公司的工程师在网上发现一种不错的生物量细胞计数的方法,在这里和大家一起分享,尽量减少人工时间,提高效率,采用数码相机和photoshop这2个工具。

由于网上的资料是采用瓜子的,所以我们直接以瓜子计数作为类推对象。出自知乎网站

1、将瓜子撒在浅色地面或浅色纸上,使其尽量分散开来;(藻细胞可以调整显微镜背景的光照度来实现)
2、数码相机拍照拷入电脑并用PS打开。若对比度不高可调节“阈值”;
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3、选择魔棒工具 > 点击空白处 > 反向,得到所有瓜子的选区。若图片中含有少量杂质或接触在一起的瓜子,可通过“选择 > 修改 > 收缩”进行去除或分离;
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4、选择“图像>分析 > 选择数据点 > 自定”。在选区中,选择“计数”并单击“确定”;
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5、选择“窗口 > 测量记录”;
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6、选择“分析 > 记录测量”;
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7、结果如下:
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注:图像处理过程可通过 “动作” 功能实现自动批处理以提高效率。

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