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标签: 藻种

什么是金藻?

光语生物实验室部分金藻

  什么是金藻?   金藻和硅藻的藻体颜色呈黄色至金棕色,这是因为它们载色体内虽然含有叶绿素a,但是更含有β-胡萝卜素和类似于叶黄素的藻黄素,而且后2种色素的含量较大,因此使藻体颜色偏黄。   金藻包括的种类也相当多,有的是单细胞,有的是分化不深的细胞群体。有些种类有鞭毛,有些则没有。   硅藻的细胞壁含有硅质,整个细胞形状像小盒子一样,通常由2片盖在一起的壳片组成。壳片上有硅质沉积,并且形成各种花纹。硅藻种类繁多,但都是单细胞的浮游植物或底栖植物。硅藻的繁殖率很高,光合作用能力也很强,因此它们是水域尤其是海洋中的重要生产者。海洋硅藻的繁殖有明显的季节性差异。此外,由于硅藻壳含有大量不能溶解或不能被取食者消化的硅酸钙、二氧化硅等硅质物,它们死亡后遗留在海底的藻壳大量堆积后就能够构成硅藻土。   红藻的藻体有的是丝状,有的是片状,有的是树枝状。它们绝大多数都生活在海里,细胞有较为坚固的细胞壁,其中纤维素成分较多,细胞群体有胶质包裹。红藻的细胞内有载色体,其中含有叶绿素a和b,还有α-胡萝卜素、叶黄素以及大量的藻红素。这些色素在不同红藻中的不同含量组合使得藻体呈现紫色、紫红色或红色。其中,藻红素是红藻所特有的。我们经常食用的紫菜以及制造琼脂所需要的石花菜都属于红藻类。   褐藻都是海生藻类,有1500多种,它们的个体都是大型的或较大型的,例如人类经常食用的海带长度一般可长到2~4米,巨藻群则被形象地称为“海中森林”,而马尾藻聚生的海区构成马尾藻海,船只航行都不得不避开它。   褐藻体内含有较多的叶黄素,使得藻体呈棕黄色,因此褐藻又称为棕藻。 金藻用途:   1分布特点金藻多分布淡水水体,生活于透明度较大,温度较低,有机质含量低的水体。对温度变化灵敏,多在寒冷季节,如早春和晚秋生长旺盛。在水体中多分布于中、下层。   2饵料价值浮游金藻没有细胞壁,个体微小,营养丰富,是水生动物很好的天然饵料,有的海产种类已人工培养,是水产经济动物人工育苗期间的重要饵料。   3颗石虫软泥和化石钙板金藻、硅鞭金藻死亡后,遗骸沉于海底,可形成颗石虫软泥,有的形成化石,可为地质年代的鉴别提供重要依据。   4三毛金藻的危害及防治小三毛金藻为一种害藻,能产生鱼毒素,引起鱼类大量死亡,在我国分布广泛,大连、银川、鸟梁素海、山西南部的咸水湖中,天津的塘沽及陕西皆有报道。此外,在海洋中也可形成赤潮,给渔业造成危害。…

赤潮藻类

赤潮藻被喻为“红色幽灵”,国际上也称其为“有害藻华”,它是海洋中某一种或某几种浮游生物在一定环境条件下爆发性繁殖或高度聚集,引起海水变色,影响和危害其它海洋生物正常生存的灾害性海洋生态异常现象。赤潮爆发时,因赤潮生物种类和数量的不同,海水可呈现红、黄、绿等不同颜色。国内外大量研究表明,海洋浮游藻是引发赤潮的主要生物,在全世界4000多种海洋浮游藻中有260多种能形成赤潮,其中有70多种能产生毒素。他们分泌的毒素有些可直接导致海洋生物大量死亡,有些甚至可以通过食物链传递,造成人类食物中毒。…

微藻保存技术

血红哈卡藻/红色裸甲藻 Akashiwo sanguinea

微藻营养丰富,是鱼、虾、贝等经济动物人工育苗的基础。特别是海洋微藻,由于富含EPA和DHA,在许多方面受到人们的青睐。在微藻的培养和应用中,保种技术十分重要,它是微藻培养和进一步应用的基础和关键环节。由于藻种极易受污染,分离培养方法比较复杂而且耗时较长,因此,在微藻保种工作中要尽量减少接种次数,避免藻种被杂藻、细菌或原生动物污染,既能达到长期贮藏种质的目的,又能维持藻种的活性,是微藻科研工作者努力的方向之一。本文就微藻保存的几种常用方法介绍如下。 一、继代法保存 继代保存法是目前普遍采用的方法,使用于一切藻种的保存。通常在常温或常低温进行。常温一般指15℃~25℃,常低温一般指0℃~15℃,藻种可接种在固体、液体或双相培养基中。接种后应首先放在适宜的光照条件下培养,待藻细胞生长繁殖达到较高密度,可见明显的条状或块状的藻细胞群时,再移置低温、弱光的条件下保藏。保藏半年到1年后必须进行转接。此方法简单易行,但是保存时间短,而且继代频繁,容易发生污染和变异。 二、固定化保存法 固定化细胞(1mmobilized cells)是指将游离细胞包埋在多糖或多聚化合物制成的网状支持物中,固定载体束缚藻种,影响其代谢过程,从而抑制细胞的生长和分裂。固定化微生物技术是在20世纪60年代固定化酶技术的基础上发展起来的,1978年以来,固定化技术就被用来作为延长光合细胞寿命的一种重要手段。但微藻存活时间从1个月到几年不等。张继红将三角褐脂藻固定在褐藻酸钙凝胶中,可保存3~5年;Tamponnet等报道了固定化纤细裸藻存活2年;矮小海链藻(Thalassiosira pseudonana)和贺氏钙板金藻 (Emiliana hux liyi)仅能保存3个月。近来孟妍等人采用褐藻胶包埋技术与干燥脱水技术相结合将绿色巴夫藻常温保存,保存时间可达6个月存活率高达77.6%。 固定化保种技术对多数微藻是适用的,该法可以在常低温下实现对藻类的中期保存,培养保存时间较长,活化复苏快,技术设备简单,细胞外渗少,而且可用于次生代谢物质的生产。在一般的微藻实验室内都能进行。但固定化程序较复杂,大多数微藻在培养后期常会从胶珠中溢出。而且,现有的资料表明,某种固定化方法只适用一定种类的微藻,对于其他种类的微藻会有不同的反应,原因复杂,还需要做更深入、广泛的研究。这就给固定化保种技术的推广带来了一定的困难。 三、超低温保种技术 所谓超低温保存区别于其他低温概念的冰箱温度(4℃~~40℃)和干冰温度(~79℃),是指在液氮低温(~196℃)下保存。此时生物体的物质代谢和生长活动几乎完全停止。可是它们仍处于可逆的成活状态。早在20世纪70年代,英国的Morris等就对海产单胞藻进行了超低温保存研究,取得了在~196℃下保存1年,存活率100%的结果。目前普遍采用两步冷冻法,即慢速降温进行冷适应,然后投入液氮中保存。王起华等用两步冷冻法研究了3种饵料金藻,其存活率均在30%左右。 超低温保存法具有保持种质遗传稳定性、对藻种进行优胜劣汰、便于长期保存、能最大限度地减少污染等方面的优点,还能省去藻种的活力监测和繁殖更新。但微藻的种类很多,生理状态各异,适宜的保存条件各不相同,找出不同微藻的超低温保种方法困难,而且不同的细胞要求不同类型、不同浓度的抗冻剂, 至今还没有找出1种对所有种类都适用的保护剂。但随着研究的深入,在探明生物细胞冻害和抗冻机理的基础上,超低温保存微藻藻种的应用前景将会是十分光明的。 四、浓缩低温保存技术 浓缩低温保存法是将藻液高密度培养后,采用物理、化学的方法浓缩1000倍左右,再低温保存。国外自80年代末开始就有对海洋经济微藻的浓缩方法和低温保存方法进行研究,取得了不少的研究成果,其中美国、英国和日本已有相应的产品(微藻浓缩细胞或称“藻膏”)问世。蒋霞敏等将小球藻和球等鞭金藻301(1sochrysis galbana Park)浓缩后,在5℃~7℃的冰箱中保存1~3个月后恢复生长获得好于常温的效果。孙建华、王如才(1993)对小新月菱形藻(Nitzschia closterium)、球等鞭金藻的浓缩和保存方法进行了研究,浓缩藻液在1℃~4℃的低温下加保护剂SAMs保存3个月,复苏后效果良好。 浓缩低温保存多用于海洋微藻。微藻浓缩液的生产,可以使海洋微藻的生产与使用保留一定的时间差。但相对保存时间较短,海洋微藻的抗逆原理还有待作更多的研究和探讨。 五、冷冻真空干燥保存法 冷冻真空干燥保存法是在极低温度下(~70℃左右)快速冷冻,然后在极低温度下真空干燥,使藻种的新陈代谢活动处于高度静止状态。19世纪末Fkral与Mudd创立的冷冻真空干燥法是迄今公认最佳的藻种保存法,严珍等选择脱脂牛奶作为保护剂,将藻液放入安瓿管中,冷冻、干燥并抽真空,火焰熔封。在低温避光处保存,预计最大保存年限为18年。冷冻干燥保存法优点是微藻复苏效果好,保藏期内可避免其他杂菌污染,便于携带运输,易实现商品化生产;其缺点是操作繁琐、对设备要求高等;应用前景十分光明。 六、低温甘油生理盐水法 低温甘油生理盐水法是对甘油原液保存法的改进。加入生理盐水适当降低了甘油的高渗作用,更有利于藻种的保存。在藻液中人一定的甘油作保护剂,同时加入一定的生理盐水,混匀后直接放置在~20℃±0.5℃冰箱放置保存。保存时间长,一般3年左右。 综上所述,单细胞藻类的保种技术尚没有发展成为一项成熟稳定的技术,许多问题还有待于我们去探索,开展微藻保种方面的研究工作,不但会填补微藻保种理论研究上的空白,还会在生产实践中发挥应有的作用。…

国外藻种购买流程说明-CCALA和CCAP购藻流程

作者:李峰(广东海洋大学) 为了课题研究,有的时候我们需要从国外藻种库购买一些藻种。境外购藻通常有两种方式,一种是通过熟人回国的时候带回来;另一种就是网购。通常情况下,网购是最常用,最有效的。鉴于我自己有2次网购的经历,现在我把我的经验分享给大家,希望能为大家提供一些参考,如果有不妥的地方还请大家批评指正,同时也希望大家能够把自己的经验分享出来,帮助更多的人。 1. 捷克藻种库CCALA 捷克藻种库,全称为Culture Collection of Autotrophic Organisms(CCALA),是捷克科学院植物研究所下属的一个机构,官方网址为:http://ccala.butbn.cas.cz/index.php。藻种价格上相对比较便宜一点,如果用于科学研究会打半折(注意,捷克是用欧元进行结算的)。下面我以购买卵囊藻(Oocystis)为例,介绍一下主要的购买流程: 首先,进入官方首页,点击Search,如图: 进入搜索页面,输入并搜索你要的藻种,如图 点击Search,进入搜索结果界面,这时你可以看见藻种编号及藻种,在藻种图片的上访有一个购物车(红色框)的图标,点击它购买藻种,如图: 这时,购物车由原来的绿色变成了橙色,同时左边的目录栏出现了橙色的购物车标志。如图: 点击目录栏的Order,查看你的购物车,显示你要购买的藻种的一些信息,如图: 根据需要选择,我个人建议选择固体和液体各1个,填写完成后,点击下方的Write Order进入购买人信息填写页面,如图 地址填写应该很简单(粉红色的必填),主要注意下面的选项,在Need the pro-forma invoice?选项中选择YES,形式发票还是需要的,这样方便你汇款转账,对于Payment preference选项,根据你个人需要选择,我选择的是bank transfer。重要的一个选项,Use of strains,建议选择academic/research,因为可以打半折^_^…,最后一个选项 Addition notes/Special requirements你可以填写你希望收货的日期、快递公司及开具证明等信息,也可以什么都不写。填写完成后,点击下面的Send Order,订单就会发给他们了,这时系统会自动生成一个word文档如图: 过一段时间,藻种库就会把电子档的发票发到你的E-mail信箱,如图: 并附上一段话,就是让你付款的。如图: 付款后,你就等着收货吧!快的话半个月左右就会收到! 注意,如果你没有特别要求,捷克藻种库会用中国邮政。你可以在他们发货后,向他们索取快递号,方便自己再网上查询到藻种运输情况。 2. 英国藻种库CCAP CCAP官方网址:http://www.ccap.ac.uk/,下面同样以卵囊藻(Oocystis)为例,简单介绍一下购买流程: 首先,进入主页,在主页中间部分点击Order Cultures>go,进入购买界面,如图: 在购买界面,悬着Search the strain data进入搜索藻种界面,如图: 输入藻种名称,并点击Search,弹出结果,如图: 点击购物车标志(红色框),将藻种加入购物车,如图: 然后再该页的上面,点击购物车标志(红色框),如图: 进入order form界面,填写客户信息,如图: 与捷克藻种库要求差不多,这里就不赘述了,填写完成后点击页面下方的Send,将订购信息发给CCAP,注意CCAP是用英镑结算的。 这里面注意,CCAP会要求你给他几周时间,如图: 是因为,他们需要时间进行接藻。所以你大约会1个月后收到藻种。 Send一段时间以后,CCAP就会给你发过来一封E-mail,主要内容是订单的信息同时希望你尽快汇款,如图: 汇款方式,前面已经介绍过了,这里提一下与捷克藻种库不同的是,CCAP发的是联邦快递,联邦快递比较贵,同时需要注意的是关税问题,关税如何收取的,超过多少钱收关税,这个我没有去找资料,我的个人经历是,从捷克藻种库购买的藻种没有交付关税,而从CCAP购买的藻种除了付了购藻的钱,我拿到货物之后又付了300多人民币的关税,原因很可能是我在CCAP购买的藻种较多,价钱超过了一定额度,但是我没有去考证。。 以上就是一些经验和主要的购买流程,应该比较详细了(可能也有点啰嗦^_^..),因为已经过去几个月的时间了,可能有些细节还是没能说明白,希望大家谅解。…

如何向NCBI提交藻种序列

(来自网络) 用 Sequin 向 NCBI 提交序列 。 Sequin下载 (下载页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html) Sequin介绍 提交的是批量而且比较复杂的序列 you are submitting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented sets 喜欢图形的界面,有更的选项和功能,可以批量修改 获得相关的分析工具 随时可以保存   Sequin提交序列图解教程   1,Sequin开始界面 开始一个新的提交或是选择编辑已有保存的文件(Read Existing Record),用Sequin的好处就是你可以保存下来,可以随时修改。直到满意后再向NCBI提交。   2,输入Title,作者,联系方式等 Title是必须的。自行添写一个。然后点Next Page到Contact菜单,添加联系方式。再Next Page,填写作者等。能填写的就填上,越详细当然是越好的。不知道的话可以跳过,因为后面也是可以重新修改的。 3,添加序列 准备一个Fasta格式的序列。保存在一个文件。可以选择单个序列或是批量序列。其它的Type都是比较特殊,不常见。 4,添加序列的注释信息 上传了序列之后,点击Next Page继续添加序列的信息,如属于哪个物种的,序列注释。有没有蛋白序列等。这里也是一样,能填的就填上,不懂就Next。后面也是可以修改的。 5,GenBank格式的界面,最后修改 Edit菜单 上面的步骤都完了之后。出现一个GenBank格式的界面,如下图。在这里,一切信息就一目了然。那里不对,需要修改的。双击就行了。另外,在Edit菜单比较修改作者、联系方式等资料。 Annotate菜单 在Annotate菜单可以添加序列的注释,也可以批量添加。如加CDS区,exon区等等。其格式可以参照其它序列的GenBank格式。 6,保存序列 如果在中途要临时保存,在File菜单的Save,保存后的文件是.sqn。全部修改完毕后,选择File/Submission。就会有一个提示框,提示把保存后的发送一封邮件到NCBI。 7,发送邮件提交序列 把保存后的.sqn文件发到gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov。等待几天,NCBI就会有回音的啦。…